分子力学シミュレーション 「GROMACS」向けワークステーション

GROMACSの計算性能を最大限発揮するアプライドおすすめのワークステーションをご紹介!

※掲載製品は参考価格となりますので、最新価格については都度お問い合わせください。

製品紹介

GROMACS(GROningen MAchine for Chemical Simulations)は、主にタンパク質、脂質、核酸などの生体分子を対象としたオープンソースの分子動力学(MD)シミュレーションソフトです。

世界で最も利用されているMDソフトの一つであり、その最大の特長は圧倒的な計算速度と高い並列性能にあります。

仕様・スペック

(カテゴリ)   (詳細仕様)
筐体       タワー筐体
OS       Ubuntu 24.04 LTS(インストール代行込)
CPU        AMD Ryzen™ Threadripper™ 9970X (4.0-5.4GHz / 32C 64T / L3 128MB / 350W)
チップセット   AMD TRX50 チップセット
CPUクーラー   360mm 簡易水冷(High-Performance Liquid Cooling)
メモリ     128GB (32GB x4) DDR5-5600 Registered ECC DIMM (1.2V / 2RANK)
ストレージ   2TB M.2 NVMe-SSD (読込:7300MB/s 書込:6600MB/s / PCIe 4.0)
グラフィックス NVIDIA® GeForce RTX™ 5080 16GB-GDDR7 (10,752コア / PCIe 5.0) ※1年保証
光学ドライブ 非搭載
ネットワーク 10GbE x1 / 2.5GbE x1 (オンボード)
IPMI 非搭載
オーディオ 7.1ch HD オーディオ (前面:ライン・マイク / 背面:ライン)
電源ユニット 1,200W 80 Plus Platinum (ATX3.0 / PCIe 5.0 / 100V)
入力装置 有線日本語キーボード(テンキー付)、有線マウス
保証 3年間センドバック方式ハードウェア保証
備考 ※GROMACSは含まれておりません

用途・実績例

創薬研究: タンパク質と薬剤候補化合物の結合自由エネルギーの推定。
生命科学: 膜タンパク質の挙動や、DNAの折り畳み構造の解析。
材料科学: 界面活性剤や高分子材料の特性評価(非生物系でも高速な非結合相互作用計算が役立ちます)

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