単一細胞RNA解析ソフト「Cell Ranger」動作用PC

遺伝子発現量をカウント可能な 「Cell Ranger」おすすめワークステーション

※掲載製品は参考価格となりますので、最新価格については都度お問い合わせください。

製品紹介

Cell RangerはscRNA-seqデータの遺伝子発現量をカウントする解析ソフトウェアです。
⇒Single cell RNA-seq(scRNA-seq)解析をするためには、フリーソフトのCell Rangerを使うと効率的です。
ただし、Cell Rangerの解析を快適に行うためには、16コア以上のCPUと 128GB以上のメモリを搭載したハイスペックコンピューティングが必要になります。

仕様・スペック

❶解析に有利な64コア CPUを搭載したHPC
APPLIED
CERVO Ryzen Type-RT9-9980X
<仕様>
■ CPU:AMD Ryzen Threadripper 9980X
(3.2-5.4GHz/64コア/128スレッド)
■ メモリ: 256GB (64GB×4) DDR5
■ ストレージ:1TB M.2 NVMe SSD
■ グラフィック:NVIDIA RTX PRO 2000 B.W. 16GB-GDDR7
(miniDisplayPort x4)miniDP to DP 変換アダプタ 1 本付属
■ OS: Ubuntu
■ 電源:1,200W(80 Plus Platinum 認証)
■ 3年間センドバック方式ハードウェア保証


❷32コア CPUを搭載で、各種人気パーツを選定した高性能モデル
APPLIED
CERVO Ryzen Type-RT9-9970X
<仕様>
■ CPU:AMD Ryzen Threadripper 9970X
(4.0-5.4GHz/32コア/64スレッド)
■ メモリ: 128GB (32GB×4) DDR5
■ ストレージ:1TB M.2 NVMe SSD
■ グラフィック:NVIDIA RTX PRO 2000 B.W. 16GB-GDDR7
(miniDisplayPort x4)miniDP to DP 変換アダプタ 1 本付属
■ OS: Ubuntu
■ 電源:1,200W(80 Plus Platinum 認証)
■ 3年間センドバック方式ハードウェア保証


❸人気のCPU搭載で構成されたコストパフォーマンスの良いモデル
APPLIED
CERVO Ryzen Type-RT9-9960X
<仕様>
■ CPU:AMD Ryzen Threadripper 9960X
(4.2-5.4GHz/24コア/48スレッド)
■ メモリ: 128GB (32GB×4) DDR5
■ ストレージ:1TB M.2 NVMe SSD
■ グラフィック:NVIDIA RTX PRO 2000 B.W. 16GB-GDDR7
(miniDisplayPort x4)miniDP to DP 変換アダプタ 1 本付属
■ OS: Ubuntu
■ 電源:1,200W(80 Plus Platinum 認証)
■ 3年間センドバック方式ハードウェア保証


※本製品に「Cell Ranger」は含まれておりません。

用途・実績例

大学・研究機関(基礎生命科学)
製薬・創薬(がん・免疫・疾患研究)
バイオテック企業・受託解析会社
再生医療・iPS細胞研究

<主な用途・事例>
■シングルセルRNA-seqデータの一次解析
FASTQ → アライメント → 遺伝子×細胞マトリクス作成
■がん研究
腫瘍内の細胞多様性、免疫細胞の構成解析
■創薬
薬の効く細胞群・効かない細胞群の特定、標的探索
■再生医療
iPS細胞・培養細胞の品質評価、細胞種構成チェック
■受託解析
シングルセル解析の「最初の標準処理パイプライン」として使用 など

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