次世代シークエンス解析ソフト「CLC Genomics Workbench」動作推奨PC
ソフトウェアの快適な動作のためには、マルチコアのCPUが重要になります!
※掲載製品は参考価格となりますので、最新価格については都度お問い合わせください。
製品紹介
CLC Genomics Workbenchは、QIAGEN社が提供する次世代シーケンサー(NGS)データの解析および可視化のための、包括的なバイオインフォマティクス・ソフトウェアです。
プログラミングやコマンドラインの知識がなくても、直感的に操作できるグラフィカル・ユーザー・インターフェース(GUI)を備えており、世界中の多くの研究機関や製薬企業で「NGS解析のスタンダードツールの1つ」として広く利用されています。
<主な特長>
■直感的な操作性 (GUI): マウス操作の使いやすいインターフェースを採用しており、ウェット系の生物学者や研究者でも、コマンド入力なしで高度なデータ解析を直感的に実行できます。
■オールインワンの解析環境: DNAシーケンス、RNAシーケンス、エピゲノム、メタゲノムなど、多様なアプリケーションに対応するツールが1つのパッケージに統合されています。
■高品質なデータの可視化: ゲノムブラウザ機能を備えており、リードのマッピング状況、バリアント(変異)、遺伝子発現プロファイルなどを、インタラクティブで高品質なグラフィックとして確認・エクスポートできます。
■幅広いシーケンサーへの対応: Illumina、PacBio、Oxford Nanopore、Ion Torrentなど、主要な次世代シーケンサーのデータフォーマットをサポートしています。
■ワークフローの自動化と共有: 複数の解析ステップを繋ぎ合わせた「ワークフロー(パイプライン)」を視覚的に作成・保存でき、チーム内での解析手順の標準化や自動化が容易です。機能拡張のためのプラグインも豊富に提供されています。
※アプライドでは、CLC Genomics Workbenchソフトを快適に動作させるためにお勧めの最新ワークステーションをご提案致します。
プログラミングやコマンドラインの知識がなくても、直感的に操作できるグラフィカル・ユーザー・インターフェース(GUI)を備えており、世界中の多くの研究機関や製薬企業で「NGS解析のスタンダードツールの1つ」として広く利用されています。
<主な特長>
■直感的な操作性 (GUI): マウス操作の使いやすいインターフェースを採用しており、ウェット系の生物学者や研究者でも、コマンド入力なしで高度なデータ解析を直感的に実行できます。
■オールインワンの解析環境: DNAシーケンス、RNAシーケンス、エピゲノム、メタゲノムなど、多様なアプリケーションに対応するツールが1つのパッケージに統合されています。
■高品質なデータの可視化: ゲノムブラウザ機能を備えており、リードのマッピング状況、バリアント(変異)、遺伝子発現プロファイルなどを、インタラクティブで高品質なグラフィックとして確認・エクスポートできます。
■幅広いシーケンサーへの対応: Illumina、PacBio、Oxford Nanopore、Ion Torrentなど、主要な次世代シーケンサーのデータフォーマットをサポートしています。
■ワークフローの自動化と共有: 複数の解析ステップを繋ぎ合わせた「ワークフロー(パイプライン)」を視覚的に作成・保存でき、チーム内での解析手順の標準化や自動化が容易です。機能拡張のためのプラグインも豊富に提供されています。
※アプライドでは、CLC Genomics Workbenchソフトを快適に動作させるためにお勧めの最新ワークステーションをご提案致します。
仕様・スペック
❶高クロックXeon w7とECC対応、Blackwell世代GPU搭載ワークステーション
CERVO Grasta Type-ALIS25WC-W7
■CPU:Xeon w7-2575X(P3.0GHz-4.6GHz/TB3.0
4.6GHz/22C(P22+E0)/44T
■メモリ:256GB(64GB x4)DDR5-5600 Registered ECC DIMM
■ストレージ:2TB M.2 NVMe-SSD + 8TB HDD
■OS:Windows 11 Pro 64bit
■GPU:NVIDIA RTX A400 4GB
■電源:1,200W/100V | 1,500W/200V(80 Plus Platinum 認証)
■3年間センドバック保証
❷高クロック×64コアThreadripper PROによる演算特化ワークステーション
CERVO Ryzen Type-RT9PRO-9985WX
■CPU:AMD Ryzen Threadripper PRO 9985WX
(3.2GHz-5.4GHz/64コア/128スレッド)
■メモリ:256GB(32GB x8)DDR5-5600 Registered ECC DIMM
■SSD:2TB M.2 NVMe-SSD + 8TB HDD
■OS:Windows 11 Pro 64bit
■GPU: NVIDIA RTX PRO 4000 24GB
■電源:1,200W 80 Plus Plutinum 認証
■3年間センドバック保証
CERVO Grasta Type-ALIS25WC-W7
■CPU:Xeon w7-2575X(P3.0GHz-4.6GHz/TB3.0
4.6GHz/22C(P22+E0)/44T
■メモリ:256GB(64GB x4)DDR5-5600 Registered ECC DIMM
■ストレージ:2TB M.2 NVMe-SSD + 8TB HDD
■OS:Windows 11 Pro 64bit
■GPU:NVIDIA RTX A400 4GB
■電源:1,200W/100V | 1,500W/200V(80 Plus Platinum 認証)
■3年間センドバック保証
❷高クロック×64コアThreadripper PROによる演算特化ワークステーション
CERVO Ryzen Type-RT9PRO-9985WX
■CPU:AMD Ryzen Threadripper PRO 9985WX
(3.2GHz-5.4GHz/64コア/128スレッド)
■メモリ:256GB(32GB x8)DDR5-5600 Registered ECC DIMM
■SSD:2TB M.2 NVMe-SSD + 8TB HDD
■OS:Windows 11 Pro 64bit
■GPU: NVIDIA RTX PRO 4000 24GB
■電源:1,200W 80 Plus Plutinum 認証
■3年間センドバック保証
用途・実績例
<主な解析用途>
ゲノミクス (DNA-Seq): 参照ゲノムへのマッピング、De novoアセンブリ、高精度な変異検出(SNP、InDel、構造変異など)。
トランスクリプトミクス (RNA-Seq): 遺伝子やトランスクリプトの発現量定量、発現変動遺伝子(DEG)の同定、単一細胞RNA-Seq(scRNA-Seq)解析。
エピゲノミクス: ChIP-Seq解析(転写因子結合部位やヒストン修飾の解析)や、Bisulfite-SeqによるDNAメチル化解析。
マイクロバイオーム解析: 16S rRNAなどのアンプリコン解析や、ショットガンメタゲノム解析による微生物群集の多様性解析。
<このような方におすすめ>
プログラミング(PythonやRなど)に不慣れだが、自分自身でNGSデータを解析・確認したい研究者。
ルーチン化された解析ワークフローを構築し、研究室全体でデータ処理を効率化・標準化したいバイオインフォマティシャンやラボの管理者。
ゲノミクス (DNA-Seq): 参照ゲノムへのマッピング、De novoアセンブリ、高精度な変異検出(SNP、InDel、構造変異など)。
トランスクリプトミクス (RNA-Seq): 遺伝子やトランスクリプトの発現量定量、発現変動遺伝子(DEG)の同定、単一細胞RNA-Seq(scRNA-Seq)解析。
エピゲノミクス: ChIP-Seq解析(転写因子結合部位やヒストン修飾の解析)や、Bisulfite-SeqによるDNAメチル化解析。
マイクロバイオーム解析: 16S rRNAなどのアンプリコン解析や、ショットガンメタゲノム解析による微生物群集の多様性解析。
<このような方におすすめ>
プログラミング(PythonやRなど)に不慣れだが、自分自身でNGSデータを解析・確認したい研究者。
ルーチン化された解析ワークフローを構築し、研究室全体でデータ処理を効率化・標準化したいバイオインフォマティシャンやラボの管理者。