単一細胞RNA解析ソフト「Cell Ranger」動作用PC
遺伝子発現量をカウント可能な 「Cell Ranger」おすすめワークステーション
※掲載製品は参考価格となりますので、最新価格については都度お問い合わせください。
製品紹介
Cell RangerはscRNA-seqデータの遺伝子発現量をカウントする解析ソフトウェアです。
⇒Single cell RNA-seq（scRNA-seq）解析をするためには、フリーソフトのCell Rangerを使うと効率的です。
ただし、Cell Rangerの解析を快適に行うためには、16コア以上のCPUと 128GB以上のメモリを搭載したハイスペックコンピューティングが必要になります。
⇒Single cell RNA-seq（scRNA-seq）解析をするためには、フリーソフトのCell Rangerを使うと効率的です。
ただし、Cell Rangerの解析を快適に行うためには、16コア以上のCPUと 128GB以上のメモリを搭載したハイスペックコンピューティングが必要になります。
仕様・スペック
解析に有利な24コア CPUを搭載したHPCです。
■ CPU： AMD Ryzen Threadripper 7960X(4.2-5.3GHz/24コア/48スレッド）
■ メモリ： 384GB （96GB× 4） DDR5-4800
■ ストレージ： 1TB M.2 NVMe SSD
■ グラフィック： NVIDIA RTX A400 4GB-GDDR6
（miniDisplayPort x4） miniDP to DP 変換アダプタ 1 本付属
■ OS： Ubuntu 22.04 LTS
■ 電源： 1,200W（80 Plus Platinum 認証）
■ 3年間センドバック方式ハードウェア保証
■ CPU： AMD Ryzen Threadripper 7960X(4.2-5.3GHz/24コア/48スレッド）
■ メモリ： 384GB （96GB× 4） DDR5-4800
■ ストレージ： 1TB M.2 NVMe SSD
■ グラフィック： NVIDIA RTX A400 4GB-GDDR6
（miniDisplayPort x4） miniDP to DP 変換アダプタ 1 本付属
■ OS： Ubuntu 22.04 LTS
■ 電源： 1,200W（80 Plus Platinum 認証）
■ 3年間センドバック方式ハードウェア保証
用途・実績例
大学・研究機関（基礎生命科学）
製薬・創薬（がん・免疫・疾患研究）
バイオテック企業・受託解析会社
再生医療・iPS細胞研究
＜主な用途・事例＞
■シングルセルRNA-seqデータの一次解析
FASTQ → アライメント → 遺伝子×細胞マトリクス作成
■がん研究
腫瘍内の細胞多様性、免疫細胞の構成解析
■創薬
薬の効く細胞群・効かない細胞群の特定、標的探索
■再生医療
iPS細胞・培養細胞の品質評価、細胞種構成チェック
■受託解析
シングルセル解析の「最初の標準処理パイプライン」として使用 など
製薬・創薬（がん・免疫・疾患研究）
バイオテック企業・受託解析会社
再生医療・iPS細胞研究
＜主な用途・事例＞
■シングルセルRNA-seqデータの一次解析
FASTQ → アライメント → 遺伝子×細胞マトリクス作成
■がん研究
腫瘍内の細胞多様性、免疫細胞の構成解析
■創薬
薬の効く細胞群・効かない細胞群の特定、標的探索
■再生医療
iPS細胞・培養細胞の品質評価、細胞種構成チェック
■受託解析
シングルセル解析の「最初の標準処理パイプライン」として使用 など
